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Análisis de imágenes en histología
Análisis de imágenes en histología
7 de Junio de 2019
El trabajo del investigador en el í¡rea médico-biológica se basa, en gran medida, en la observación de cambios morfológicos y estructurales, a la cual dedica un tiempo considerable. Dadas las dimensiones de las muestras y el detalle que se desea observar, la primera herramienta para describir los cambios es el microscopio. Tal como lo hací­a Antonie van Leeuwenhoek, el investigador observa, medita y vuelve a observar, toma notas y trata de dar una explicación a lo observado.
Las imí¡genes que se adquieren de un microscopio sin importar su tipo son valiosas per se, dada la información que brindan, y no me refiero solo a los bonitos colores o cambios que pueden apreciarse, si no a la información que de esta imagen se puede extraer. Por ejemplo, en una célula podemos medir varios parí¡metros y hacer estadí­stica tan solo de la morfologí­a de la célula, utilizando datos como la rugosidad, la redondez y el dií¡metro; o bien, podemos hacer clasificaciones de color en algún proceso donde podamos generar una escala de colores que correspondan a un estado especí­fico de nuestra muestra analizada, como en los procesos de maduración de frutos.
Estas caracterí­sticas pueden ser extraí­das por softwares disponibles en lí­nea, mediante el procesamiento de aní¡lisis de imagen (PAI), el cual es una herramienta que permite extraer información de las imí¡genes obtenidas e interpretar de manera objetiva los resultados. Por ejemplo, el PAI se puede llevar acabo en imí¡genes de histologí­a convencional para determinar forma y tamaí±o de las células u organelos observados, o en imí¡genes obtenidas de microscopia electrónica para evaluar í¡reas de la célula que presenten caracterí­sticas de interés, incluso podemos cuantificar las células y su perí­metro. Estas herramientas nos permiten incluir un aní¡lisis estadí­stico/computacional.
A continuación, se detallan las etapas del aní¡lisis de imagen:
1. Adquisición de la imagen: En esta etapa se adquiere la imagen con una cí¡mara digital para su posterior aní¡lisis (si la imagen a analizar estuviese en papel, se necesita escanear para obtenerla en formato digital). Es importante tomar en cuenta el tamaí±o de la imagen, su escala de colores y resolución.
2. Pre-procesamiento de la imagen: la imagen original debe ser respaldada en un sitio seguro, por si en algún momento necesitamos regresar a la condición original de la misma, por ello se trabaja con una copia de la imagen original, a la cual se le da un tratamiento previo. Es recomendable trabajar con imí¡genes a color RGB que son transformadas a escala de grises, ya que para hacer mediciones es mí¡s sencillo de manipular.
3. Segmentación o umbraleo: En esta etapa, se requiere tener precisión, ya que es donde vamos a hacer la separación de la zona de estudio o interés de la imagen completa para analizarla.
4. Aní¡lisis/Extracción de datos: Finalmente en esta etapa se eligen los parí¡metros que se desean extraer de la región seleccionada previamente.

Estas son a grandes rasgos las aplicaciones y pasos para el aní¡lisis de imí¡genes histológicas, convirtiendo comentarios subjetivos, como lo son: disminución en la tinción, cambios tintoriales, positividad +, en parí¡metros objetivos, como: diferencias estadí­sticamente significativas en la positividad inmunohistoquí­mica, aumento significativo en el dií¡metro celular de las muestras tratadas, etc.
Si desean pueden dejar sus dudas o comentarios con respecto a este tema en la sección de comentarios.

Dra. Dulce Estefania Nicolí¡s ílvarez
https://www.sociedadmexicanadehistologia.com/8_directorio/299_Profesora-del-departamento-de-fisiologia.html

 
Recomendar en:
Facultad de Medicina, Universidad Autonoma de Coahuila, Torreón, Coahuila, Mexico
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